در فیلم روز استقلال 2: تجدید حیات 2016 ، داستان 20 سال پس از اتفاقات نسخه اول فیلم به وقوع می پیوندد. انسان ها که موفق شده بودند فضایی ها و بیگانگان را با تجهزیات اندک از زمین بیرون کنند، اکنون آنها با قدرتی فراتر از گذشته برای نابودی زمین برگشته اند. مهندس ماهواره ای دیوید لوینسون (جف گلدبلوم) متوجه می شود که یک کشتی مادر (وسیله نظامی بیگانگان) که 3000 متر گستردگی دارد در حال نزدیک شدن به زمین است تا لشکری عظیم از بیگانگان را در آن مستقر هستند را بر روی زمین پیاده کند. رئیس جمهور امریکا نیز گروهی آموزش دیده متشکل از حرفه ای ترین خلبانان را برای نابودی و آنالیز این وسیله به فضا می فرستد ولی …